pymol 311开源版： 一款常用的分子对接软件

软件介绍

Pymol是一个开源项目，现在由Schrödinger开发、支持和管理，有企业版、政府和学术版、教学版，还有开源版。除了开源版和教学版外，其他都是需要付费购买的。目前从网络上下载的Edu版的pymol有很多功能限制，对于要发表文章需要图片渲染等高级功能的用户来说极为不便。

本文就讲解下免费开源版PyMOL的安装教程，适用于window系统32位和64位系统，PyMOL 有2.1，2.3和2.4等版本。

Window系统的pymol运行需要依赖python环境、PMW模块。PyMOL软件以Py+MOL命名：“Py”表示它是由一种计算机语言Python所衍生出来的，“MOL”表示它是用于显示分子（英文为molecule）结构的软件。为什么选择Pymol，因为它是强大的分子可视化软件，具有诸多优点：

1高质量科学论文发表图形

2动画制作

3文档文件和会话文件并存

4鼠标操作与命令行操作

5免费的开放源码。

PyMOL适用于创作高品质的小分子或是生物大分子（特别是蛋白质）的三维结构图像。

而Pymol的安装是通过一个python包（Python Wheels）安装的，因此在开始之前，我们需要根据系统的位数（32位还是64位）以及python的版本来选择pymol包进行下载。本文是以win10家庭版本（64位）和python3.11.0为例子进行安装。本文所有涉及的安装包和文件，均在文末提供，无需回复即可获取。

安装教程

安装教程内置网盘里面了，大家仔细阅读

软件下载

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